Protein–RNA interactions for Protein: Q99PW4

Tp53rk, TP53-regulating kinase, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53rkQ99PW4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53rkQ99PW4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms