Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE8

Abcg5, ATP-binding cassette sub-family G member 5, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg5Q99PE8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcg5Q99PE8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcg5Q99PE8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcg5Q99PE8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms