Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtn4Q99P72 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtn4Q99P72 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms