Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a6cQ99N08 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ms4a6cQ99N08 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ms4a6cQ99N08 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms