Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tm2d1Q99MB3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms