Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nus1Q99LJ8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms