Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clint1Q99KN9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clint1Q99KN9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms