Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR6

Nmnat3, Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmnat3Q99JR6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nmnat3Q99JR6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nmnat3Q99JR6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms