Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC34.8■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
LRRIQ1Q96JM4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
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