Protein–RNA interactions for Protein: Q920A5

Scpep1, Retinoid-inducible serine carboxypeptidase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scpep1Q920A5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scpep1Q920A5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scpep1Q920A5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms