Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Pde6cQ91ZQ1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Pde6cQ91ZQ1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Pde6cQ91ZQ1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Pde6cQ91ZQ1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pde6cQ91ZQ1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pde6cQ91ZQ1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pde6cQ91ZQ1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pde6cQ91ZQ1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pde6cQ91ZQ1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pde6cQ91ZQ1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pde6cQ91ZQ1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pde6cQ91ZQ1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pde6cQ91ZQ1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pde6cQ91ZQ1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pde6cQ91ZQ1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde6cQ91ZQ1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde6cQ91ZQ1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde6cQ91ZQ1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde6cQ91ZQ1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Pde6cQ91ZQ1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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