Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pth2Q91W27 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pth2Q91W27 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms