Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW32

HMGB4, High mobility group protein B4, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB4Q8WW32 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB4Q8WW32 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB4Q8WW32 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB4Q8WW32 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB4Q8WW32 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB4Q8WW32 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB4Q8WW32 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB4Q8WW32 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB4Q8WW32 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB4Q8WW32 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB4Q8WW32 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB4Q8WW32 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB4Q8WW32 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB4Q8WW32 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB4Q8WW32 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms