Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc12Q8R344 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms