Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gtf3c5Q8R2T8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf3c5Q8R2T8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms