Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrtm1Q8K377 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms