Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q0

Commd9, COMM domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd9Q8K2Q0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Commd9Q8K2Q0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Commd9Q8K2Q0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Commd9Q8K2Q0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Commd9Q8K2Q0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Commd9Q8K2Q0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Commd9Q8K2Q0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Commd9Q8K2Q0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Commd9Q8K2Q0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Commd9Q8K2Q0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Commd9Q8K2Q0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd9Q8K2Q0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms