Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf3c1Q8K284 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c1Q8K284 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms