Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nek9Q8K1R7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek9Q8K1R7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms