Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D5

Gfm1, Elongation factor G, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfm1Q8K0D5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfm1Q8K0D5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfm1Q8K0D5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms