Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9030612E09RikQ8CE20 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms