Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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