Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Scfd2Q8BTY8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scfd2Q8BTY8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms