Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ckap4Q8BMK4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ckap4Q8BMK4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms