Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpc2Q8BKV1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms