Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms