Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ83

Tm2d3, TM2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d3Q8BJ83 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tm2d3Q8BJ83 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm2d3Q8BJ83 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm2d3Q8BJ83 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm2d3Q8BJ83 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm2d3Q8BJ83 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm2d3Q8BJ83 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm2d3Q8BJ83 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm2d3Q8BJ83 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm2d3Q8BJ83 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm2d3Q8BJ83 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm2d3Q8BJ83 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm2d3Q8BJ83 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm2d3Q8BJ83 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm2d3Q8BJ83 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm2d3Q8BJ83 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms