Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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