Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ell3Q80VR2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms