Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cul9Q80TT8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms