Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdp1Q7TSG2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms