Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMN8

Zfp420, MCG144734, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp420Q7TMN8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zfp420Q7TMN8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp420Q7TMN8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms