Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sys1Q78S06 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms