Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed3Q78IS1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 328.1 ms