Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trpv1Q704Y3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpv1Q704Y3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpv1Q704Y3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms