Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Igsf3Q6ZQA6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Igsf3Q6ZQA6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Igsf3Q6ZQA6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms