Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LcorQ6ZPI3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms