Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp8b3Q6UQ17 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp8b3Q6UQ17 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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