Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja6Q6S5G4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Gja6Q6S5G4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms