Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tcaf3Q6QR59 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcaf3Q6QR59 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcaf3Q6QR59 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcaf3Q6QR59 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcaf3Q6QR59 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcaf3Q6QR59 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcaf3Q6QR59 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcaf3Q6QR59 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcaf3Q6QR59 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcaf3Q6QR59 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcaf3Q6QR59 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcaf3Q6QR59 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcaf3Q6QR59 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcaf3Q6QR59 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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Tcaf3Q6QR59 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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Tcaf3Q6QR59 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
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Tcaf3Q6QR59 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcaf3Q6QR59 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcaf3Q6QR59 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcaf3Q6QR59 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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Tcaf3Q6QR59 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Tcaf3Q6QR59 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Tcaf3Q6QR59 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcaf3Q6QR59 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Tcaf3Q6QR59 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcaf3Q6QR59 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcaf3Q6QR59 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Tcaf3Q6QR59 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Tcaf3Q6QR59 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Tcaf3Q6QR59 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
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Tcaf3Q6QR59 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Tcaf3Q6QR59 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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