Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGD0

Atraid, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtraidQ6PGD0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtraidQ6PGD0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtraidQ6PGD0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms