Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms