Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt40Q6IFX3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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