Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nop58Q6DFW4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms