Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms