Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hes3Q61657 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hes3Q61657 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms