Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna2Q61301 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnna2Q61301 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms