Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxd4Q60688 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxd4Q60688 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Foxd4Q60688 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms