Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf123Q5XPI3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf123Q5XPI3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms