Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR78Q5VTH9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms